Vaihtoehtoisen silmukoinnin epigeneettinen säätely

Kampelatutkija yritti epätoivoisesti eilen väittää, että DNA sanelee eliöiden ruumiinkaavan, eli ns. body plan:in. Hän käytti esimerkissään Hedelmäkärpästen Pax6 -geeniä, jota hän ilmeisesti edelleen pitää silmägeeninä, eli silmän rakenteen sanelevana geeninä. Oikaisin hänen räpellyksensä kertomalla, että todellisuudessa Pax6 on proteiini, joka toimii ns. transkriptiotekijänä sitoutuen epigeneettisiin informaatiomarkkereihin, eli metylaatioprofiileihin. Solu ei tuota ainuttakaan proteiinia ilman epigeneettistä ohjausta, ei myöskään Pax6-transkriptiotekijää.

Pax6-proteiini on myös vaihtoehtoisen silmukoinnin tuote, eli sitä ei koodata suoraan periaatteella DNA --> RNA --> Proteiini vaan DNA:sta transkriptoitua pre-mRNA:ta modifioidaan epigeneettisillä ohjausrakenteilla siten, että solu kykenee tuottamaan vaadittua proteiinia. On siis pseudotieteelistä väittää, että DNA sanelisi body plan:in. Ottakoon Kampelatutkija nyt opiksi virheistään.

Seuraavaksi hieman tarkempaa tietoa vaihtoehtoisesta silmukoinnista. Korjataan samalla toinenkin Kampelatutkijan virheellinen väite. Hän nimittäin väitti, että 40-60% ihmisen proteiineja koodaavista geeneistä kävisi läpi vaihtoehtoisen silmukoinnin. Todellisuudessä luku on reilusti yli 90%, nykytietämyksen mukaan peräti 95%. Oikea ilmaisu mekanismille on kuitenkin se, että n. 95% proteiinien koodaamiseen luettavasta DNA:sta käy läpi vaihtoehtoisen silmukoinnin pre-mRNA-tasolla.

No nyt varsinaiseen asiaan. On aika tutkia, mitkä tekijät ohjaavat ja säätelevät vaihtoehtoista silmukointia. Käyttäkäämme apunamme tieteellistä tutkimusta vuodelta 2018:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6325479/

Tutkimuksessa todetaan seuraavasti liittyen vaihtoehtoista silmukointia ohjaaviin mekanismeihin ja tekijöihin:

"Alternative splicing (AS) serves as an additional regulatory process for gene expression after transcription, and it generates distinct mRNA species, and even noncoding RNAs (ncRNAs), from one primary transcript. Generally, AS can be coupled with transcription and subjected to epigenetic regulation, such as DNA methylation and histone modifications. In addition, ncRNAs, especially long noncoding RNAs (lncRNAs), can be generated from AS and function as splicing factors (“interactors” or “hijackers”) in AS. Recently, RNA modifications, such as the RNA N6-methyladenosine (m6A) modification, have been found to regulate AS. In this review, we summarize recent achievements related to the epigenetic regulation of AS."

Nykytutkimuksen mukaan vaihtoehtoista silmukointia ohjaavat ja säätelevät puhtaasti epigeneettiset tekijät ja mekanismit, eli DNA:n metylaatioprofiilit (vahvistajat, hiljentäjät ja promoottorit), histonien epigeneettiset MARKKERIT sekä koodaamattomat RNA-molekyylit, joita tuotetaan mm. vaihtoehtoisen silmukoinnin sivutuotteena.

Epigeneettisiin informaatioprofiileihin vaikuttavat puolestaan ravinto, ilmasto, stressitekijät, ympäristömyrkyt, aistiärsykkeet jne. Eliöissä tapahtuvat muutokset eivät siis perustu satunnaisiin mutaatioihin ja kuviteltuun valintaan vaan suunniteltuihin mekanismeihin, jotta muuttuviin ympäristöolosuhteisiin olisi eliöiden mahdollista adaptoitua nopeasti ja tehokkaasti. Epigeneettiset modifikaatiot ovat myös palautuvia, mikäli eliössä ei ole tapahtunut kovin paljon informaatiohäviötä. Muutos ei ole evoluutiota vaan vaihtoehtoisten biologisten ohjelmien päälle/pois -kytkentää.

20

72

    Vastaukset

    Anonyymi (Kirjaudu / Rekisteröidy)
    5000
    • Anonyymi

      Luonnonvalinnan kohteena ovat suoranaisesti eliöiden ilmiasut, ja vain välillisesti eliöiden ilmiasun aiheuttavat perinnölliset mekanismit.

    • Anonyymi

      Ja luominen tuli taas todistetuksi ties monettako kertaa? Montako kertaa se pitää todistaa että se on viimeinkin totta?

      • Anonyymi

        Alan tulla siihen johtopäätökseen että luomisesta ei ole mitään todisteita, ja siksi kretut pelkäävät puhua siitä.

        Yrittävät hämätä epätoivoisesti kaikkia puhumalla evoluutiosta, mutta siinäkin näyttävät epäonnistuvan kun ei näytä olevan tarpeeksi tietoa :(


      • Anonyymi

        Rotilla on aivan väärä paikka "todistelulle", Ei muuta kuin Maailman johtaville Yliopistoille Luennoimaan, niin napsahtaa Nobelpalkinto!!! Sitten juhlimme Rotia oikein porukalla Noobelista!!


    • Lähtökohtaisesti olettaisin että rotti ei taaskaan tiedä yhtään mitään asiasta vaan plaginoi saarnansa joltakin amerikan ihmemaan saarnamieheltä...

    • Anonyymi

      Kampelatutkija joutuu koko aika korjaamaan sinun virheitä ja et silti opi, sinulla on paha oppimisvaikeus

    • Anonyymi

      "Solu ei tuota ainuttakaan proteiinia ilman epigeneettistä ohjausta, ei myöskään Pax6-transkriptiotekijää. "
      Ei myöskään ilman DNAta.

      Luonnonvalinta on havaittavissa jo siinä, että monissa eliölajeissa jopa 50 % jälkeläisistä menehtyy ennen kuin ne ovat sukukypsiä.

    • "vaan DNA:sta transkriptoitua pre-mRNA:ta modifioidaan epigeneettisillä ohjausrakenteilla siten, että solu kykenee tuottamaan vaadittua proteiinia."

      Ja ne epigeneettiset ohjausrakenteet perustuvat DNA:aan. Tätä olen yrittänyt opettaa sinulle jo kohta vuoden verran. Tässä on kyse juuri niistä signaalimolekyyleistä, joista sinulla ei ole mitään havaintoa.

      "The control of alternative RNA splicing is performed by a complex network of signaling molecules that respond to a wide range of intracellular and extracellular signals. "

      • Anonyymi

        //Ja ne epigeneettiset ohjausrakenteet perustuvat DNA:aan.//

        Ja taas meni väärin. DNA ei tuota metyyliryhmiä eikä histonien epigeneettisiä markkereita. Ne saadaan ravinnosta. Niiden paikalleenviemisestä huolehtivat tietyt entsyymit, jotka ovat proteiineja ja joita ei tuoteta ilman epigeneettistä ohjausta.

        Milloin opit?


      • Anonyymi
        Anonyymi kirjoitti:

        //Ja ne epigeneettiset ohjausrakenteet perustuvat DNA:aan.//

        Ja taas meni väärin. DNA ei tuota metyyliryhmiä eikä histonien epigeneettisiä markkereita. Ne saadaan ravinnosta. Niiden paikalleenviemisestä huolehtivat tietyt entsyymit, jotka ovat proteiineja ja joita ei tuoteta ilman epigeneettistä ohjausta.

        Milloin opit?

        "Milloin opit?"

        Milloin sinä opit ettei tämäkään todista luomista mitenkään?


      • Anonyymi kirjoitti:

        //Ja ne epigeneettiset ohjausrakenteet perustuvat DNA:aan.//

        Ja taas meni väärin. DNA ei tuota metyyliryhmiä eikä histonien epigeneettisiä markkereita. Ne saadaan ravinnosta. Niiden paikalleenviemisestä huolehtivat tietyt entsyymit, jotka ovat proteiineja ja joita ei tuoteta ilman epigeneettistä ohjausta.

        Milloin opit?

        Silmukoinnin ohjaus, silmukointikoodi on DNA:ssa olevaa perinnöllistä koodia. Koodiin vaikuttaa myös epigenetiikka koska kyseessä on kahden tai useamman geeninsäätelyketju. Suomeksi sanottuna geeni tuottaa signaalimolekyylejä, joilla säädellään toisten geenien ilmentymistä.

        Olet täysin väärässä DNA:n merkityksestä. Silmukoinnin koodi on periytyvää. Epigenetiikasta olet osittain oikeassa, mutta ympäristön vaikutuksella on merkitystä oikeastaan vain poikkeamissa. Ihmisestä tulee ihminen DNA:n ohjaamana, ei siksi että äiti syö tai ei syö maustekurkumaa jne.

        ” Therefore, our goals are to decipher the extended splicing (epi)genetic code compiling not only the genetic elements but also the epigenetic properties, to understand how they interplay with each another in regulating AS and contributing to various biological processes, such as development and disease progress.”

        https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5716079/


      • Anonyymi
        Anonyymi kirjoitti:

        //Ja ne epigeneettiset ohjausrakenteet perustuvat DNA:aan.//

        Ja taas meni väärin. DNA ei tuota metyyliryhmiä eikä histonien epigeneettisiä markkereita. Ne saadaan ravinnosta. Niiden paikalleenviemisestä huolehtivat tietyt entsyymit, jotka ovat proteiineja ja joita ei tuoteta ilman epigeneettistä ohjausta.

        Milloin opit?

        Epigeenisyys on siis mielestäsi täysin riippuvaista ravinnon sisältämistä metyyliryhmistä.

        Mitä tapahtuisi epigeenisyydelle tilanteessa, jossa ravinto ei sisältäisi yhtään metyyliryhmiä, verrattuna tilanteeseen, jossa ravinto sisältäisi maksimaalisen määrän metyyliryhmiä (miten paljon se nyt sitten mahtaa ollakaan)?


      • Anonyymi
        Anonyymi kirjoitti:

        //Ja ne epigeneettiset ohjausrakenteet perustuvat DNA:aan.//

        Ja taas meni väärin. DNA ei tuota metyyliryhmiä eikä histonien epigeneettisiä markkereita. Ne saadaan ravinnosta. Niiden paikalleenviemisestä huolehtivat tietyt entsyymit, jotka ovat proteiineja ja joita ei tuoteta ilman epigeneettistä ohjausta.

        Milloin opit?

        Milloin sinä opit ettei epigeneettisillä markkereilla tee mitään ilman cis-säätelyalueita jotka ovat DNA sekvenssejä?

        https://en.wikipedia.org/wiki/Cis-regulatory_element


      • Anonyymi
        Anonyymi kirjoitti:

        Milloin sinä opit ettei epigeneettisillä markkereilla tee mitään ilman cis-säätelyalueita jotka ovat DNA sekvenssejä?

        https://en.wikipedia.org/wiki/Cis-regulatory_element

        No juurihan kerroin näistä. Tärkeimmät ovat vahvistajat (enhancers), promoottorit (promoters) ja vaimentajat (silencers). Nämä ovat METYLOITUNEITA DNA:n alueita, eli epigeneettiset informaatioprofiilit tarvitaan DNA:n päälle, ennen kuin en säätelevät yhtään mitään.

        Milloin opit?

        Hakusanat:

        enhancer methylation
        promoter methylation
        silencer methylation


      • Anonyymi
        Kampelatutkija kirjoitti:

        Silmukoinnin ohjaus, silmukointikoodi on DNA:ssa olevaa perinnöllistä koodia. Koodiin vaikuttaa myös epigenetiikka koska kyseessä on kahden tai useamman geeninsäätelyketju. Suomeksi sanottuna geeni tuottaa signaalimolekyylejä, joilla säädellään toisten geenien ilmentymistä.

        Olet täysin väärässä DNA:n merkityksestä. Silmukoinnin koodi on periytyvää. Epigenetiikasta olet osittain oikeassa, mutta ympäristön vaikutuksella on merkitystä oikeastaan vain poikkeamissa. Ihmisestä tulee ihminen DNA:n ohjaamana, ei siksi että äiti syö tai ei syö maustekurkumaa jne.

        ” Therefore, our goals are to decipher the extended splicing (epi)genetic code compiling not only the genetic elements but also the epigenetic properties, to understand how they interplay with each another in regulating AS and contributing to various biological processes, such as development and disease progress.”

        https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5716079/

        //silmukointikoodi on DNA:ssa olevaa perinnöllistä koodia.//

        Ja taas väärin. Silmukointikoodiin vaikuttavat monet epigeneettiset informaatiorakenteet, kuten DNA:n metylaatioprofiilit, histonien epigeneettiset markkerit ja koodaamattomien RNA-molekyylien välittämä epigeneettinen informaatio.

        Heittelet omia juttujasi randomisti päästä ja kuvittelet, ettei kukaan tarkista niitä.


      • Anonyymi
        Anonyymi kirjoitti:

        Epigeenisyys on siis mielestäsi täysin riippuvaista ravinnon sisältämistä metyyliryhmistä.

        Mitä tapahtuisi epigeenisyydelle tilanteessa, jossa ravinto ei sisältäisi yhtään metyyliryhmiä, verrattuna tilanteeseen, jossa ravinto sisältäisi maksimaalisen määrän metyyliryhmiä (miten paljon se nyt sitten mahtaa ollakaan)?

        Saamme raaka-aineet epigeneettisiä merkintöjä varten ravinnosta, mutta niiden paikalleenasettumiseen vaikuttavat useat ympäristötekijät. Tämä mahdollistaa nopean ja tehokkaan adaptoitumisen muuttuvassa ympäristössä.


      • Anonyymi
        Anonyymi kirjoitti:

        No juurihan kerroin näistä. Tärkeimmät ovat vahvistajat (enhancers), promoottorit (promoters) ja vaimentajat (silencers). Nämä ovat METYLOITUNEITA DNA:n alueita, eli epigeneettiset informaatioprofiilit tarvitaan DNA:n päälle, ennen kuin en säätelevät yhtään mitään.

        Milloin opit?

        Hakusanat:

        enhancer methylation
        promoter methylation
        silencer methylation

        Hakusanat:

        Why do people laugh at creationists


      • Anonyymi kirjoitti:

        //silmukointikoodi on DNA:ssa olevaa perinnöllistä koodia.//

        Ja taas väärin. Silmukointikoodiin vaikuttavat monet epigeneettiset informaatiorakenteet, kuten DNA:n metylaatioprofiilit, histonien epigeneettiset markkerit ja koodaamattomien RNA-molekyylien välittämä epigeneettinen informaatio.

        Heittelet omia juttujasi randomisti päästä ja kuvittelet, ettei kukaan tarkista niitä.

        "Heittelet omia juttujasi randomisti päästä ja kuvittelet, ettei kukaan tarkista niitä."

        No enpä heittele. Kommentti perustui lainaukseen tästästä tutkimuksesta. Avainsanat "splicing genetic code, genetic elements, epigenetic properties. Ilman DNA:ta ei olisi olemassa myöskään epigeneettisiä ominaisuuksia.

        ” Therefore, our goals are to decipher the extended splicing (epi)genetic code compiling not only the genetic elements but also the epigenetic properties, to understand how they interplay with each another in regulating AS and contributing to various biological processes, such as development and disease progress.”

        https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5716079/


      • Anonyymi
        Anonyymi kirjoitti:

        No juurihan kerroin näistä. Tärkeimmät ovat vahvistajat (enhancers), promoottorit (promoters) ja vaimentajat (silencers). Nämä ovat METYLOITUNEITA DNA:n alueita, eli epigeneettiset informaatioprofiilit tarvitaan DNA:n päälle, ennen kuin en säätelevät yhtään mitään.

        Milloin opit?

        Hakusanat:

        enhancer methylation
        promoter methylation
        silencer methylation

        "Milloin opit?"

        Milloin ite? Ei ne ole mitään metyloituneita alueita vaan tietyt sekvenssit omaavia DNA jaksoja joiden osia metyloidaan ja demetyloidaan.


    • Anonyymi

      Kukahan täällä on se epätoivoinen väittäjä? Olet todistanut luomisen jo monta kertaa, miksi edelleen jauhat asiaa?

    Ketjusta on poistettu 0 sääntöjenvastaista viestiä.

    Luetuimmat keskustelut

    1. Saako kaunis ihminen parempaa kohtelua?

      Onko kauniin ihmisen elämä "helpompaa" kuin tavallisen näköisen ihmisen? Olen kuullut väittämän, että kaunis ihminen saa
      Sinkut
      115
      3153
    2. Ei ole kyllä mennyt

      Kovin hyvin kun alussa pieni sekoaminen hänestä 😏
      Ikävä
      12
      2046
    3. En rehellisesti usko et oisit

      Sekuntiakaan oikeasti mua kaivannut. Tai edes miettinyt miten mulla menee. Jotenkin todennäköisesti hyödyt tästäkin jos
      Ikävä
      37
      1895
    4. Suomennettua: professori Jeffrey Sachs avaa Ukrainan sodan taustat luennollaan EU parlamentissa

      Jeffrey Sachs on yhdysvaltalainen ekonomisti. Sachs toimii Columbian yliopiston The Earth Instituten johtajana. Aiemmin
      NATO
      401
      1763
    5. Näin sinusta taas unta!

      Unessa olin pakahtuneesti rakastunut sinuun. Olimme vanhassa talossa jossa oli yläkerran huoneissa pyöreät ikkunat. Pöly
      Ikävä
      21
      1661
    6. Nainen, olet jotenkin lumoava

      Katselen kauneuttasi kuin kuuta, sen loistoa pimeässä. Sen kaunis valo on kaunista sekä herkkää ja lumoavaa. Olet naisel
      Ikävä
      68
      1477
    7. Olet muutenkin tyhmä

      Ja käyttäydyt epäasiallisesti siinä työssäsi.
      Ikävä
      120
      1311
    8. En muuttaisi sinusta mitään

      Ensin olit etäinen ja yritin pysyä tutkan alapuolella. Mutta ei silmiltäsi jää mitään huomaamatta, kuten minulla ei kuul
      Ikävä
      10
      1201
    9. Se sinun kaipauksen kohde

      Ei todellakaan käy täällä höppänä mies.
      Ikävä
      13
      1196
    10. Et katso sitä

      Niinkuin minua. Ehkä se luo toivetta
      Ikävä
      20
      1059
    Aihe